İstanbul Silivri’de çiftçi bir ailenin çocuğu olan Şeref Can Ayata; Silivri Anadolu Teknik Lisesi Elektrik-Elektronik, İstanbul Üniversitesi Elektrik, Eskişehir Anadolu Üniversitesi İşletme ve yine Eskişehir Anadolu Üniversitesi Yönetim Bilişim Sistemleri mezunudur. İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsünde Siyaset Bilimi ve Kamu yönetimi bölümünde Yüksek Lisans ile İstanbul Ticaret Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsünde Kentsel Sistemler ve Ulaştırma Yönetimi bölümleri olmak üzere iki yüksek lisans tamamlamıştır.

Özel sektörde Sistem Uzmanı ve Bilgi İşlem Yöneticisi olarak görev aldıktan sonra, 2009 yılında Silivri Belediyesinde Sözleşmeli Memur kadrosunda Bilgi İşlem Müdürü olarak görevlendirilmiştir. 

Görev yaptığı süre boyunca Sistem ve Bilgi Güvenliği, Sunucu Sanallaştırma, e-dönüşüm alanlarında çalışmalarını sürdürerek Silivri Belediyesi’nin eBYS( Elektronik Belge Yönetim Sistemi) ve Dijital Arşiv çalışmalarını tamamlayan ve KEP üzerinden Elektronik imzalı tebligatı yapan ilk belediye olmasını sağlamıştır. Silivri Belediyesi’nin TS EN ISO 9001 Kalite Yönetim Sistemi ile ISO 27001 belgelerini alan ilk kamu kurumları arasında yer almasını sağlayan süreci yönetmiştir, ayrıca Kent Bilgi Sistemi altyapısı ile gelir artırıcı çalışmalar kapsamında kent envanteri taraması yaparak GAÇ (Gelir Artırıcı Çalışma) biriminin kurulmasını sağlamıştır. Dijital İmar Durumu sürecini tasarlayarak E-İMAR, e-RUHSAT gibi Türkiye’nin ilklerini hayata geçirmiştir ayrıca Kamu İhale Mevzuatı, İş Sağlığı Güvenliği ve Proje Döngüsü Yönetimi konularında çalışmalar yapmıştır. 

SİLKENT Silivri Kent Hizmetleri A.Ş yönetim kurulu başkanlığı görevini yürüterek, Günlük 10.000 kapasiteli yeni ekmek üretim fabrikası, 250 Dekar arazi üzerinde kurulu TÜRAM (Tarımsal Üretim ve Araştırma Merkezi) ile Türkiye’nin İlk Ücretsiz Tarım Lisesi olan TÜRAM Özel Silivri Tarımsal Üretim Araştırma Merkezi Mesleki ve Teknik Anadolu Lisesini hayata geçiren ekibin koordinasyonunda yer almıştır. 

MCP, MCSE S M, MCITP ve MCSA gibi BT alanında mesleki sertifikalara sahip olan Şeref Can AYATA. Nisan 2019 tarihinde İstanbul Şişli Belediyesi’nde Bilgi İşlem Müdürü ve İşletmeler Müdürü, Temmuz 2019 tarihinde İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanı Ekrem İmamoğlu tarafından İBB ye atanan ilk bürokratlardan biri olarak Bilgi İşlem Müdürlüğü görevine getirilmiştir. Akabinde Haziran 2020 tarihinden İETT İşletmeleri Genel Müdürlüğü Bilgi İşlem Dairesi Başkanı olarak atanmıştır. 

İETT de görev yaptığı süre boyunca kurumun BT altyapısının revizyonu, Akıllı Ulaşım Sistemleri ve Elektrikli Otobüsler üzerine çalışmalar yapmıştır. 6400 İETT hizmetindeki otobüsün Araç içi Elektronik sistemlerinin 7/24 çalışır vaziyette kalmasını sağlayan ekibi yönetmiş, ÖHO Dijital dönüşümü ile Dünyanın en büyük mobilite projesini hayata geçirmiş ve 3041 Özel Halk Otobüsünün dijital dönüşümünü gerçekleştirmiştir. İETT’nin TS EN ISO 27701 kalite belgesini alan ilk kamu kurumu olmasını sağlamıştır. İstanbul Kalkınma Ajansı Destekli Güvenli Sürüş sistemini hayata geçirmiştir. Türkiye de bir ilk olan Görme Engelliler için araç içi QR ve Braille alfabesi projesini 6400 adet otobüste hayata geçirmiştir. eBRT (electric Bus Rapid Transit) geçişi ve fizibilite çalışmalarını başlatarak Avrupa Birliğinden 200.000€ hibe alınmasını sağlamış, Türkiye’nin Dizelden Elektrikliye çevrilen ilk alçak tabanlı toplu taşıma otobüsünü hizmete çıkarmıştır.

2024 Mahalli idareler seçimlerinde Cumhuriyet Halk Partisinden Silivri Belediye Başkanlığına aday adayı olmak için görevinden ve memuriyetten çekilmiştir.

Nisan 2024 tarihinde Şişli Belediyesinde İdari ve Teknolojik alanlardan sorumlu Başkan Yardımcısı olarak atanmıştır.

 Motosiklet, Doğa ve Hayvan sever olarak yaşamını sürdüren Ayata, Çağdaş Yaşamı Destekleme Derneği, Atatürkçü Düşünce Derneği, Çevre Derneği, Silivri Motosiklet Kulübü gibi çeşitli sivil toplum kuruluşlarında aktif görev almaktadır, eşi Hande hanım ile birlikte Sherlock ve Enola isimli kedileri ile yaşamaktadır.